クラウド会計ソフト 個人事業主 比較｜選び方ガイド
公開日: 2026/6/7
【広告（PR）】本記事にはアフィリエイト広告（PR）を含みます。料金・プラン名・キャンペーン・各社の仕様は変動するため、2026年6月時点の情報であり、最新は各公式サイトでご確認ください。
「クラウド会計ソフト 個人事業主 比較」で情報を探している方の多くは、freee会計・マネーフォワード クラウド確定申告・弥生（やよいの青色申告 オンライン）の3つで迷っている傾向があります。本記事では、選定基準を表で整理し、タイプ別の選び方まで案内します。まずは結論から押さえ、最後に診断ツールで自分に合うタイプを確認する流れがおすすめです。
なお、ソフト選びの前提として、確定申告全体の流れを把握しておくとミスが減る傾向があります。初めての方は確定申告の流れ（初めての人向け）や青色申告のやり方もあわせてご覧ください。
1. 最初に押さえたい「青色申告65万円控除」の要件
会計ソフト選びでつまずきやすいのが、「入門プランだと青色申告に対応していないのでは？」という誤解です。結論として、freee・マネーフォワード・弥生はいずれも入門プラン（freeeスターター／MFパーソナルミニ／弥生セルフ）から青色申告（複式簿記・e-Tax）に対応し、65万円控除の要件を満たせる場合があります。
入門プランと上位プランの差は「青色／白色の別」ではない点が共通していますが、何で差がつくかは会社によって異なる傾向があります。freeeとマネーフォワードでは消費税申告（インボイス対応）機能の有無が主な差で、freeeはスタンダード以上、マネーフォワードはパーソナル以上が消費税申告に対応するとされています。一方、弥生（やよいの青色申告 オンライン）はプランの違いが主にサポート範囲にあるとされますが、消費税申告（インボイス対応）の対応プランは上位プランや関連製品での扱いを含め変動しうるため、各公式での確認をおすすめします（2026年6月時点・最新は各公式で要確認）。
青色申告特別控除65万円の要件は、おおむね次の組み合わせです。
- 複式簿記での記帳
- 貸借対照表・損益計算書を期限内に提出
- e-Taxによる電子申告 または 優良な電子帳簿保存
これらを満たさない場合、控除額は55万円（または簡易な記帳等の場合は10万円）にとどまる場合があります（国税庁の規定による。詳細は出典参照）。
補足：令和8年度税制改正大綱では控除区分の見直し（75万／65万／10万、令和9年分以後）が示されていますが、2026年6月時点では大綱段階で未施行の見込みであり、大綱では最大75万円への引き上げ等が示されていますが、改正法の成立前（未施行）です。断定はできず、最新は国税庁の情報で要確認です。
インボイス登録をすべきか迷っている方は、インボイス登録の判断も参考にしてください。
2. クラウド会計ソフト比較表（個人事業主向け）
選定基準を「料金／青色対応／操作性／サポート／連携」の5軸で整理しました。下表は傾向をまとめたもので、料金・仕様は変動します（2026年6月時点・最新は各公式で要確認）。
| 項目 | freee会計 | マネーフォワード クラウド確定申告 | 弥生（やよいの青色申告 オンライン） |
|---|---|---|---|
| 入門プラン名 | スターター | パーソナルミニ | セルフプラン |
| 青色65万円控除 | 対応（要件充足時） | 対応（要件充足時） | 対応（要件充足時） |
| 消費税申告（インボイス対応） | スタンダード以上で対応 | パーソナル以上で対応 | 上位プラン・関連製品での対応を要確認 |
| プラン差の主な軸 | 機能差（消費税申告等） | 機能差（消費税申告等） | サポート範囲の差が中心とされる |
| 操作性の傾向 | 簿記知識が浅くても入力しやすい設計の傾向 | 仕訳・会計の考え方に沿った画面構成の傾向 | シンプルで確定申告に特化した画面の傾向 |
| サポートの傾向 | プランによりチャット等のサポート差あり | プランによりサポート差あり | プランごとにサポート範囲が分かれる傾向 |
| 銀行・カード等の連携 | 自動連携に対応 | 自動連携に対応 | 自動連携に対応 |
| 無料お試し | 用意される傾向 | 用意される傾向 | 一定期間の無料利用枠がある傾向 |
※ プラン名・対応範囲・料金・キャンペーンは変更される場合があります。最新は各公式サイトでご確認ください。3社の違いをさらに深掘りしたい方は会計ソフトの比較やfreeeとマネーフォワードの比較もご覧ください。
各製品の詳細・お試しは公式から確認できます（広告・PR）。
- freee会計：freee会計の公式サイトを見るPR
- マネーフォワード クラウド確定申告：マネーフォワード クラウド会計・確定申告の公式サイトを見るPR
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3. タイプ別・選び方の目安
どれが「正解」というより、自分の状況に合うかで選ぶと失敗しにくい傾向があります。以下は目安です。
簿記の知識が浅く、入力の迷いを減らしたい場合
質問に答える形で入力が進む設計を好む方には、freee会計が候補になりやすい傾向があります。初めての記帳でつまずきにくい設計を重視する方に向く場合があります。なお消費税申告（インボイス対応）が必要な場合はスタンダード以上が対応とされています（2026年6月時点・最新は公式で要確認）。詳細・お試しは公式で確認できます（広告・PR）：freee会計の公式サイトを見るPR
仕訳や会計の考え方に沿って操作したい・他のMFサービスと揃えたい場合
従来の会計ソフトに近い画面構成を好む方や、マネーフォワード系サービスと連携させたい方には、マネーフォワード クラウド確定申告が候補になりやすい傾向があります。消費税申告（インボイス対応）が必要な場合はパーソナル以上が対応とされています（最新は公式で要確認）（広告・PR）：マネーフォワード クラウド会計・確定申告の公式サイトを見るPR
コストを抑えつつ、確定申告に特化したシンプルさを求める場合
画面をシンプルに保ち、確定申告書類の作成に絞って使いたい方には、弥生（やよいの青色申告 オンライン）が候補になりやすい傾向があります。弥生はプランの違いが主にサポート範囲にあるとされ、サポートの手厚さで選びやすい場合があります。消費税申告（インボイス対応）が必要な場合の対応プランや、料金・キャンペーン（初年度無償の有無など）は変動するため公式で要確認です（広告・PR）：やよいの青色申告 オンラインの公式サイトを見るPR
迷ったら、いくつかの質問に答えるだけでタイプ別の候補を提示する会計ソフト診断を試してみてください。
4. 比較で見落としがちなチェックポイント
- 消費税申告の要否とプランの選び方：課税事業者（インボイス登録者など）は消費税申告に対応するプランが必要です。freeeはスタンダード以上、マネーフォワードはパーソナル以上が対応とされ、弥生は上位プラン・関連製品での対応を要確認です。年の途中で課税事業者になる予定があるかも確認しておくと安心です（最新は各公式で要確認）。
- 連携している金融機関・決済：普段使う銀行・クレジットカード・決済サービスとの自動連携可否は、入力の手間に直結する傾向があります。
- サポート体制：初年度は不明点が出やすいため、チャット・電話などサポートの手厚さを重視する選び方もあります。プランによりサポート範囲が異なる傾向があり、弥生のようにサポート範囲でプランが分かれるケースもあります。
- 料金は変動前提で確認：キャンペーンや成果条件、プラン名は変わる場合があるため、申込前に各公式で最新を確認してください。
開業前後の方は、開業届の出し方や開業届のオンライン提出もあわせて確認しておくと手続きの抜け漏れを減らせる傾向があります。なお、開業届の控えへの収受日付印（収受印）は2025年1月から押なつを行わない運用となり、窓口・郵送いずれも希望者にリーフレット等（受付日・税務署名の記載）が交付・返送される運用です。会計ソフト選びの直接の判断材料ではありませんが、提出方法とあわせて押さえておくと安心です（出典参照）。
将来的に法人化を視野に入れている方は、法人化のタイミングとメリット、経費管理の観点で法人カードの比較やバーチャルオフィスの比較も参考になる場合があります（具体的な単価・審査基準・最新プランは各公式で要確認。審査の可否を保証する断定はできません）。
まとめ
クラウド会計ソフトは、freee・マネーフォワード・弥生のいずれも入門プランから青色申告65万円控除の要件を満たせる場合があります。プランの主な違いは会社により異なり、freee・マネーフォワードは消費税申告（インボイス対応）機能の有無が中心です。弥生はサポート範囲が中心とされますが、消費税申告の対応プランは要確認です。料金・仕様・キャンペーンは変動するため、2026年6月時点の情報として捉え、最新は各公式で確認のうえ、無料お試しで実際に触って選ぶ方法もおすすめです。タイプ別に迷ったら本文の診断ツールをご利用ください（各製品の詳細は広告・PRリンク先の公式でご確認ください）。
出典
- 国税庁「青色申告特別控除を受けるための要件」 https://www.nta.go.jp/taxes/shiraberu/taxanswer/shotoku/2072.htm
- 国税庁「令和7年1月からの申告書等の控えへの収受日付印の押なつについて」 https://www.nta.go.jp/taxes/tetsuzuki/onatsu/index.htm
- 財務省「税制改正」関連情報（令和8年度税制改正大綱を含む。年度別ページの移動・リンク到達性は要確認） https://www.mof.go.jp/tax_policy/tax_reform/outline/index.html
- freee会計 個人事業主向け料金（公式） https://www.freee.co.jp/accounting/individual/pricing/
- マネーフォワード クラウド確定申告 料金（公式） https://biz.moneyforward.com/tax_return/price/
- 弥生（やよいの青色申告 オンライン）料金（公式） https://www.yayoi-kk.co.jp/shinkoku/aoiroshinkoku/price/
※ 各URL先の内容・料金・仕様・キャンペーンは変更される場合があります。2026年6月時点の情報であり、最新は各公式・国税庁・財務省等でご確認ください。